El equipo de investigación del Instituto Max Planck de Biología, la Universidad de Tubinga y el Hospital Universitario ha desarrollado recientemente un método innovador de diseño de proteínas, proporcionando nuevas ideas para el desarrollo de fármacos dirigidos. Los resultados de esta investigación se han publicado en la revista Advanced Science.

El flujo de cómputo desarrollado por el equipo utiliza tecnología de coincidencia de formas complementarias, diseñando agentes de unión proteicos sin depender del entrenamiento de redes neuronales. La primera autora, Kateryna Maksymenko, indicó: "Nuestro objetivo es desarrollar un flujo de diseño sin necesidad de entrenamiento, que no solo cree agentes de unión específicos de sitios, sino que también profundice la comprensión de la función proteica".

El método ya se ha aplicado exitosamente para diseñar agentes de unión proteicos dirigidos a dos biomoléculas clave: IL-7Rα, relacionada con la función inmune y la leucemia, y VEGF, involucrada en la angiogénesis. El equipo integró cribado de bases de datos proteicas, diseño de interfaces físicas y simulación de dinámica molecular para desarrollar agentes de unión con alta afinidad y estabilidad.

"Este flujo de diseño simplifica el proceso de ingeniería proteica y, al mismo tiempo, profundiza nuestra comprensión de las bases físicas de la función proteica", señalaron los investigadores. El nuevo método también puede integrar aminoácidos artificiales en las proteínas diseñadas, proporcionando posibilidades para el desarrollo de fármacos terapéuticos más seguros.

Esta tecnología se basa completamente en principios fundamentales, aplicable no solo a proteínas codificables genéticamente, sino también al diseño de proteínas sintéticas. El equipo indicó que este avance tiene el potencial de acelerar el descubrimiento de fármacos terapéuticos y traer nuevas oportunidades para el diagnóstico molecular.