es.wedoany.com Noticia: NVIDIA ha lanzado el NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit, un conjunto de herramientas especializadas para flujos de trabajo de IA en ciencias de la vida.
Este kit integra bibliotecas, herramientas y modelos abiertos desarrollados por NVIDIA durante más de una década, con el objetivo de ayudar a agentes de IA, científicos y laboratorios a procesar datos científicos, incluyendo la recopilación de evidencia, el análisis de hallazgos, la ejecución de experimentos computacionales y la recomendación de pasos siguientes.
El kit puede utilizarse para asistentes generales, agentes científicos, plataformas de software y sistemas biofarmacéuticos internos, proporcionando herramientas para resumir conocimiento científico, invocar modelos, evaluar resultados, razonar hallazgos y ejecutar tareas posteriores.
El kit incluye NVIDIA BioNeMo y emplea tecnologías como NVIDIA NIM microservices, NVIDIA Parabricks, NVIDIA NeMo y NVIDIA Nemotron, junto con herramientas de computación acelerada.
Más de 50 empresas están utilizando este kit para flujos de trabajo que abarcan predicción de estructuras de proteínas, acoplamiento molecular, química generativa, análisis genómico, diseño de proteínas y descubrimiento de biomarcadores.
Instituciones como Arc Institute, Open Molecular Software Foundation y el Instituto de Diseño de Proteínas de la Universidad de Washington (University of Washington’s Institute for Protein Design) están colaborando con NVIDIA para aplicar BioNeMo en modelos de investigación y hacerlos accesibles mediante flujos de trabajo basados en agentes. NVIDIA afirma que la colaboración con el Instituto de Diseño de Proteínas ha mejorado el rendimiento en tiempo de ejecución de modelos como RosettaFold3, alcanzando aproximadamente el doble de rendimiento en comparación con la generación anterior.
La investigación en ciencias de la vida implica grandes presupuestos de I+D en instituciones científicas y farmacéuticas. Los flujos de trabajo basados en agentes ayudan a los investigadores a iterar más rápido, reducir costos y mejorar la eficiencia del trabajo científico. NVIDIA señala que el kit permite a los desarrolladores adaptar agentes generales para usos en ciencias de la vida, ayudando a los investigadores a ejecutar experimentos más rápidamente, aprender de los resultados y acortar el ciclo entre hipótesis y análisis. Algunas empresas también están extendiendo estos flujos de trabajo a entornos de laboratorio físico.
Los agentes generales pueden tener dificultades para manejar flujos de trabajo científicos, ya que deben inferir las herramientas, entradas, salidas y contexto biológico correctos. NVIDIA indica que BioNeMo Agent Toolkit está diseñado para ayudar a los agentes a seleccionar las herramientas adecuadas, interpretar resultados y respaldar el análisis científico.
NVIDIA está adaptando la plataforma BioNeMo para que los agentes puedan invocar directamente bibliotecas, modelos y marcos de trabajo. Esto incluye el modelo abierto NVIDIA Nemotron para razonamiento, la biblioteca NVIDIA NeMo RL para aprendizaje por refuerzo y el blueprint NVIDIA NemoClaw para agentes capaces de colaborar entre tareas, invocar herramientas e interactuar con datos.
Los microservicios NVIDIA NIM se utilizan para el acceso a modelos y la ejecución de tareas. El runtime NVIDIA OpenShell proporciona el entorno de ejecución para estos flujos de trabajo.
Los flujos de trabajo compatibles con el kit incluyen: cribado virtual, donde los agentes ayudan a identificar candidatos a fármacos de molécula pequeña generando y filtrando compuestos, acoplándolos a dianas, prediciendo la fuerza de unión y filtrando por similitud a fármacos; el sistema luego clasifica los compuestos candidatos para su revisión adicional. Análisis genómico y descubrimiento de dianas, donde los agentes procesan datos de secuenciación para obtener hallazgos genéticos y dianas biológicas priorizadas; NVIDIA Parabricks se utiliza para alineamiento y detección de variantes, los modelos genómicos fundamentales puntúan los efectos de las variantes, y los agentes clasifican las dianas candidatas para su posterior estudio. Diseño de ligandos proteicos, donde los agentes ayudan a los investigadores a diseñar y evaluar computacionalmente ligandos candidatos antes de comenzar el trabajo de laboratorio. Flujos de trabajo de investigación biomédica, donde los agentes conectan fuentes de datos con modelos de razonamiento para tareas como revisión bibliográfica, generación de protocolos, cribado de ensayos clínicos y farmacovigilancia. Análisis de imágenes médicas, donde los agentes procesan, segmentan, sintetizan y analizan datos de imágenes médicas para flujos de trabajo como descubrimiento de biomarcadores y generación de evidencia.
Empresas de los sectores tecnológico y de ciencias de la vida están utilizando el kit para flujos de trabajo basados en agentes. Desarrolladores de agentes científicos, incluyendo Anthropic, Edison Scientific, Lila Sciences, OpenAI y Owkin, están integrando BioNeMo para flujos de trabajo de investigación y análisis. NVIDIA afirma que sus modelos y bibliotecas de análisis ayudan a acortar el tiempo entre la generación de hipótesis y los resultados.
Plataformas de datos y herramientas, incluyendo Benchling, Certara, Databricks, Snowflake y Seqera, están utilizando BioNeMo Agent Toolkit para conectar sistemas de datos científicos con flujos de trabajo de IA. Las herramientas de BioNeMo ayudan a los agentes a consultar conjuntos de datos biológicos y químicos, preparar entradas de modelos, iniciar flujos de trabajo reproducibles, analizar salidas y devolver resultados dentro de las plataformas utilizadas por científicos y equipos de datos.
Empresas de diagnóstico y farmacéuticas, incluyendo Lilly y Natera, están utilizando BioNeMo Agent Toolkit en sus flujos de trabajo de descubrimiento, investigación traslacional y análisis clínico. Empresas de IA centradas en biología, incluyendo Boltz, Basecamp Research, Chai Discovery, Dyno, PerturbAI y Proxima, han colaborado con NVIDIA para desarrollar herramientas de flujos de trabajo de diseño terapéutico basadas en modelos. Empresas de software de descubrimiento de fármacos, incluyendo Dassault Systèmes, Cadence (OpenEye) y Schrödinger, están integrando las capacidades del kit en aplicaciones científicas utilizadas en flujos de trabajo de descubrimiento, permitiendo que los agentes coordinen tareas de generación molecular, acoplamiento y predicción dentro de entornos de software existentes. Empresas de instrumentos de laboratorio y automatización, incluyendo Automata, HighRes, Tecan, Thermo Fisher y Medra, están utilizando herramientas de BioNeMo para conectar sistemas de laboratorio con flujos de trabajo computacionales. Proveedores de infraestructura y nube de IA, incluyendo Baseten, Modal y Nebius, están utilizando el kit para respaldar flujos de trabajo de ciencias de la vida gestionados, ofreciendo API, computación gestionada y entornos de inferencia, con el objetivo de apoyar el despliegue de aplicaciones basadas en BioNeMo para investigadores y empresas.
BioNeMo Agent Toolkit y sus habilidades ya están disponibles a través de la página de recursos para desarrolladores de NVIDIA y GitHub.
